Перегляд вихідного коду сторінки Математичне моделювання інфекційних захворювань

{{Вікіфікувати|дата=липень 2017}}

'''Математичні моделі''' дають змогу продемонструвати розвиток [[Інфекційні захворювання|інфекційних захворювань]], щоб показати можливі наслідки [[Епідемія|епідемій]] та вчасно проінформувати заклади охорони здоров'я, щодо можливих спалахів хвороби. Ці моделі використовують деякі базові припущення в галузі [[Медицина|медицини]] та математичні перетворення, для того щоб знайти параметри для різних інфекційних захворювань, та використати ці параметри для обчислення наслідків від можливих заходів, таких як програма масової [[Вакцинація|вакцинації]].

== Історія ==
Першопрохідцями в моделюванні інфекційних захворювань були: Вільям Гамер<ref>Hamer, W. (1928). Epidemiology Old and New. London: Kegan Paul</ref> та [[Рональд Росс]], який на початку XX століття застосував закон дії мас, щоб пояснити поведінку епідемії. [[Ловелл Рід]] і [[Вейд Гемптон Фрост]] розробили епідемічну модель Reed-Frost, щоб описати зв'язок між сприйнятливими до захворювання, інфікованими і тими що набули імунітету особинами в популяції.

Подальшим розвитком відповідної теорії стала так звана [[Полігамні_моделі_в_епідеміології#Модель SIR|SIR модель]], розроблена у 1920-х роках О. Кермаком та Андерсоном Греєм МакКендріком<ref>Слюсар В.И. Data Farming на основе пандемической статистики.//I Міжнародна науково-практична Інтернет-конференція «Вплив пандемії COVID-19 на розвиток сучасного світу: загрози та можливості». 9 – 10 вересня 2021. – Дніпро. – С. 174 - 177. [https://slyusar.kiev.ua/Conference%209_10_Sept_2021.pdf {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20210917132131/https://slyusar.kiev.ua/Conference%209_10_Sept_2021.pdf |date=17 вересня 2021 }}]</ref>.

== Загальні поняття ==
; ''R''<sub>0</sub>
: середнє число особин [[Популяція|популяції]], кожна з яких може заразити осіб популяції, які не мають імунітету до цього захворювання.
; ''S''
: частина особин популяції сприйнятливих до захворювання.
; ''A''
: середній вік особин популяції, в якому спадає чисельність інфікованих особин для заданої популяції.
; ''L''
: середня тривалість життя для даної популяції.

== Припущення ==
Моделі залежать від припущень на яких вони базуються. Якщо отримані результати моделі не відповідають спостереженням і математичне формулювання є коректним, то нам слід змінити початкові умови, щоб мати змогу використати задану модель.
* Прямокутний, стаціонарний розподіл за віком, тобто кожна особина популяції живе до часу L, а потім помирає, також кожна вікова категорія популяції має однакову чисельність. Це часто використовується в розвинутих країнах, де існує низька дитяча смертність і висока тривалість життя.
* Рівномірне змішування популяції, тобто особини популяції вступають в контакт випадковим чином і здебільшого не змішуються в менші підгрупи. Це припущення рідко знаходить своє виправдання, оскільки соціальні структури є широко поширеними. Наприклад, більшість мешканців Лондона вступають в контакт переважно з іншими мешканцями Лондона. Крім того, в Лондоні є менші підгрупи, такі як турецька громада, або спільнота осіб підліткового віку, які змішуються одні з одними набагато більше, ніж поза межами своїх спільнот. Проте однорідне змішування є стандартним припущенням, для того щоб отримати змогу побудувати математичну модель.

== Стан стійкості ендемічних захворювань ==
[[Файл:SIR model anim.gif|thumb|right|250px|Анімована SIR модель поширення інфекційного захворювання]]
Інфекційна хвороба є [[ендемія|ендемічною]] в популяції, коли ця хвороба постійно підтримується в цій популяції без потреби в зовнішніх джерелах. Це означає, що, в середньому, кожна інфікована особа заражає рівно одну особину (більше того, кількість інфікованих людей буде зростати експоненційно, що спричинить епідемію, проте з часом хвороба спадатиме). В математичних позначеннях, це означатиме, що:
: <math>
\ R_0 \ = 1.
</math>
Коефіцієнт поширення (''R''<sub>0</sub>) захворювання, припускаючи, що кожна особа є сприйнятливою до захворювання, помножений на частку осіб популяції, сприйнятливих до захворювання (''S''), повинен бути визначеним єдиним чином (тому особини, які не є сприйнятливими до захворювання, не враховуватимуться в обчисленнях, так як вони не можуть бути інфікованими). Зауважимо, для того щоб захворювання перебувало в стані стійкості, необхідно, щоб виконувалось наступне співвідношення: чим більший коефіцієнт поширення захворювання, тим менше число осіб популяції, схильних до захворювання, і навпаки.
Припустимо, що заданий прямокутний, стаціонарний розподіл за віком та однакове поширення інфекції на кожну вікову групу популяції. Нехай ''A''&nbsp;— середній вік особин, на яких поширюється інфекція, причому особи молодші за ''A'' є сприйнятливими до захворювання, а ті, які старші,&nbsp;— несприйнятливі. Тоді можна показати, що частка осіб популяції, сприйнятливих до захворювання, задається як:
: <math>
S = \frac{A}{L}.
</math>
Проте, згідно з визначенням стану стійкості ендемічного захворювання:
: <math>
S = \frac {1} {R_0}.
</math>
Тому згідно з [[Транзитивне відношення|транзитивним відношенням]]:
: <math>
\frac {1} {R_0} = \frac {A} {L} \Rightarrow R_0 = \frac {L} {A}.
</math>
Використавши вхідні дані, отримуємо простий спосіб оцінки параметра ''R''<sub>0</sub>.
Для населення з [[Віково-статева піраміда|експоненційним віковим розподілом]]
: <math>
R_0 = 1 + \frac {L} {A}.
</math>
Це дає змогу обчислити коефіцієнт поширення захворювання для будь-якого розподілу популяції.

== Динаміка інфекційних захворювань ==
Математичні моделі повинні об'єднувати в собі зростаючий об'єм даних, викликаний [[Хазяїн|хост]]-[[Патоген|патогенними]] взаємодіями. Багато теоретичних досліджень динаміки росту популяцій, структури та еволюції інфекційних захворювань рослин і тварин, включаючи людей, є пов'язаними із цією проблемою. Зокрема є такі напрямки досліджень:
* поширення та контроль захворювання
* [[Епідеміологія|епідеміологічні]] мережі
* [[Простір|просторова]] епідеміологія
* [[Імунна система|імунна]] епідеміологія
* [[Вірулентність|вірулентність]]
* [[Штам|штам]] структури і взаємодії
* антигенна мутація
* [[Генетика популяцій|генетика популяції]] мікроорганізмів
* роль генетичних чинників хазяїна організму
* статистичні та математичні інструменти та інновації
* роль та ідентифікація місць поширення інфекції

== Математичний опис вакцинації популяції ==
Якщо частка осіб, які мають імунітет до захворювання, перевищує [[Колективний імунітет|колективний імунітет]] для цього захворювання, то в цій популяції, інфекція не може поширюватись. Також це співвідношення може бути перевищеним при вакцинації населення, що призводить до усунення хвороби. Прикладом успішного використання вакцинації є подолання спалахів [[Натуральна віспа|віспи]] у світі(останній раз глобальний спалах якої був у 1977 році). [[Всесвітня організація охорони здоров'я|ВООЗ]] проводить схожу кампанію вакцинації з викорінення поліомієліту. Позначимо ''q''&nbsp;— рівень колективного імунітету. Нагадаємо, що для стану стійкості:
: <math>
\ R_0 \cdot S = 1.
</math>
''S'' буде рівним (1&nbsp;−&nbsp;''q''), оскільки ''q''&nbsp;— частка популяції, яка має імунітет і ''q''&nbsp;+&nbsp;''S'' має бути рівним одиниці(так як в цій спрощеній моделі, кожна особина популяції є або сприйнятливою до захворювання, або має імунітет). Тоді:
: <math> \ R_0 \cdot (1-q) = 1, </math>
: <math> 1-q = \frac {1} {R_0}, </math>
: <math> q = 1 - \frac {1} {R_0}. </math>
Зауважимо, що рівень колективного імунітету є граничним. Якщо частка осіб з імунітетом перевищує цей рівень, в результаті програми масової вакцинації, хвороба буде відмирати.
У проведених вище обчисленнях, ми знайшли поріг критичної імунізації популяції(позначається, як ''q<sub>c</sub>''). Це мінімальна частка популяції, яка повинна бути імунізованою при народженні (або близько до народження) для того, щоб інфекція не мала змоги поширюватись в популяції.
: <math> q_c = 1 - \frac {1} {R_0} </math>

=== Вакцинація популяції не перевищує рівня колективного імунітету ===
Якщо вакцинація популяції є недостатньою(наприклад у зв'язку із великим опором населення), кількість вакцинованого населення може не перевищувати поріг критичної імунізації. В результаті цього може порушитись збереження рівноваги поширення інфекції, що може викликати непередбачувані наслідки. Припустимо, що частка населення ''q'' (де ''q'' < ''q<sub>c</sub>'') є вакцинованою від інфекції з народження із ''R''<sub>0</sub>>1. Програма вакцинації змінилась із ''R''<sub>0</sub> до ''R''<sub>''q''</sub>, де
: <math>
\ R_q = R_0(1-q)
</math>
Ця зміна стає можливою завдяки зменшенню кількості особин сприйнятливих до захворювання, які можуть бути інфікованими. R<sub>q</sub> дорівнюватиме R<sub>0</sub> мінус ті особини, які зазвичай є зараженими, проте в даний момент мають імунітет.
Внаслідок цього середній вік особин, на яких поширюється інфекція ''A'', також зміниться на деяке нове значення ''A''<sub>q</sub>, тих осіб, які залишились не щепленими.
Використаємо описаний вище зв'язок між R<sub>0</sub>, ''A'' та ''L''. Якщо припустити, що середня тривалість життя не змінилася, отримуємо:
: <math>\ R_q = \frac {L} {A_q},</math>
: <math>\ A_q = \frac {L} {R_q} = \frac {L} {R_0(1-q)}.</math>

Проте ''R''<sub>0</sub> = ''L''/''A'' тому:

: <math>\ {A_q} = \frac {L} {(L/A)(1-q)} = \frac {AL} {L(1-q)} = \frac {A} {1-q}.</math>

Таким чином, програма вакцинації підвищить середній вік інфекції. Не вакциновані особи відчуватимуть зменшену силу дії інфекції через присутність вакцинованих. Тим не менш, важливо враховувати позитивний ефект при вакцинації проти захворювань, які мають більш серйозні прояви, у літніх людей. Програма вакцинації проти захворювання, яке не перевищує ''q''<sub>''c''</sub>, може викликати більше смертей і ускладнень, ніж було до того, як програма була введена в дію, якщо люди будуть хворіти пізніше. Ці непередбачувані результати програми вакцинації називаються '''небажаними наслідками'''.

=== Вакцинація популяції перевищує рівень колективного імунітету ===
Якщо в результаті програми вакцинації частка особин популяції, в яких є імунітет, перевищує критичний поріг, поширення інфекційних захворювань в цій популяції припиниться.

== Див. також ==
* [[Базове репродуктивне число]]
* [[Моделювання екосистем]]

== Примітки ==
{{reflist}}

== Література ==
* {{cite book |title=Infectious Diseases of Humans |first=Roy M. |last=Anderson |first2=Robert M. |last2=May |isbn=0-19-854040-X }}
* {{cite book |title=Modeling Infectious Diseases: In Humans and Animals |first=Matt |last=Keeling |first2=Pej |last2=Rohani |publisher=Princeton University Press |location=Princeton |year= |isbn= }}
* {{cite book |url=http://anintroductiontoinfectiousdiseasemodelling.com/ |title=An Introduction to Infectious Disease Modelling |first=Emilia |last=Vynnycky |first2=Richard G. |last2=White |location= |publisher= |year= |accessdate=2016-02-15 |archive-date=22 лютого 2016 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160222150833/http://anintroductiontoinfectiousdiseasemodelling.com/ }} An introductory book on infectious disease modelling and its applications.
* {{cite book |title=Smallpox and its Eradication |last=Jenner |location= |publisher= |year= |isbn= }}
* {{cite journal |author=Riley S |title=Large-scale spatial-transmission models of infectious disease |journal=Science |volume=316 |issue=5829 |pages=1298–301 |date=June 2007 |pmid=17540894 |doi=10.1126/science.1134695 |url=http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/316/5829/1298 |accessdate=17 травня 2017 |archive-date=12 лютого 2009 |archive-url=https://web.archive.org/web/20090212205811/http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/316/5829/1298 }}

== Посилання ==

<!--leave a double space below this line to separate vaccines template from the external link list above -->
* [http://www.idmod.org/ Institute for Disease Modeling] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170518031328/http://idmod.org/ |date=18 травня 2017 }}
* [http://www.emdis.ox.ac.uk/ Institute for Emerging Infections, University of Oxford] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170226093056/https://www.emdis.ox.ac.uk/ |date=26 лютого 2017 }}
* [http://cidma.yale.edu/ Center for Infectious Disease Modeling and Analysis, Yale School of Public Health] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170722073306/http://cidma.yale.edu/ |date=22 липня 2017 }}
* [http://www.cidd.psu.edu/ Center for Infectious Disease Dynamics, The Pennsylvania State University] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20160115144137/http://www.cidd.psu.edu/ |date=15 січня 2016 }}
* [http://www.infectiousdisease.cam.ac.uk/ Cambridge Infectious Diseases] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170507015436/http://www.infectiousdisease.cam.ac.uk/ |date=7 травня 2017 }}
* [http://cmmid.lshtm.ac.uk/ Centre for the Mathematical Modelling of Infectious Diseases] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20130419214130/http://cmmid.lshtm.ac.uk/ |date=19 квітня 2013 }}, London School of Hygiene & Tropical Medicine
* [https://web.archive.org/web/20170522045326/http://epimodels.org/ Models of Infectious Disease Agent Study]
* [http://apmonitor.com/wiki/index.php/Apps/MeaslesVirus Infectious Disease Modeling: Measles Virus] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20101206153852/http://apmonitor.com/wiki/index.php/Apps/MeaslesVirus |date=6 грудня 2010 }} <!--
Software -->
* [http://model-builder.sourceforge.net/ Model-Builder] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170530162959/http://model-builder.sourceforge.net/ |date=30 травня 2017 }}: Interactive (GUI-based) software to build, simulate, and analyze ODE models.
* [http://tb-mac.org/ Tuberculosis Modelling and Analysis Consortium (TB MAC)] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170519032634/http://tb-mac.org/ |date=19 травня 2017 }}: Group focused on improving global Tuberculosis control by coordinating and promoting mathematical modelling and other quantitative research activities.
* [http://www.gleamviz.org/ GLEaMviz Simulator] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170527043942/http://www.gleamviz.org/ |date=27 травня 2017 }}: Enables simulation of emerging infectious diseases spreading across the world.
* [http://www.eclipse.org/stem/ STEM] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170527084039/http://www.eclipse.org/stem/ |date=27 травня 2017 }}: Open source framework for Epidemiological Modeling available through the Eclipse Foundation.
{{Ерадикація та елімінація інфекційних хвороб}}
{{Медицина}}

[[Категорія:Епідеміологія]]
[[Категорія:Математичне моделювання]]
[[Категорія:Медична статистика]]